m6A RNA甲基化研究的前期探索性实验思路|干货系列

日期:23-05-04

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近年来,m6A RNA甲基化作为国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域,相关研究成果层出不穷,高分文章不断。研究方向包括疾病发生发展、发育和分化、环境暴露与响应等。


研究人员为m6A甲基化课题申请作准备以及为降低m6A甲基化实验风险,通常会进行m6A甲基化研究的前期探索性实验,主要包括:

l   检测m6A writersreaderserasers的表达

l   检测整体m6A甲基化水平变化

l   m6A writersreaderserasers基因干扰/敲除/过表达

l   其他前期实验

 

一、检测m6A writersreaderserasers的表达

方法包括:



e.g. 小鼠脑损伤前后观察到METTL14FTORNA表达显著变化



二、检测整体m6A甲基化水平变化

方法包括:


三、m6A writersreaderserasers基因干扰/敲除/过表达

方法包括:

²  检测处理后潜在m6A修饰基因的蛋白表达

²  检测处理后所研究的表型和功能变化


三、m6A writersreaderserasers基因干扰/敲除/过表达

方法包括:



白质翻译水平下调,METTL3/14过表达又造成相关基因蛋白质水平上调。

 

四、其他前期实验

在没有条件开展甲基化相关前期实验的情况下,也可以开展其他预实验。如:

 

 

 

在进行前期探索性预实验后,m6A RNA甲基化的研究思路与项目设计还包括:技术选择、数据挖掘、下游验证。

l   技术选择:


 

²  理解每一步数据分析的目的和依据

²  如何筛选m6A调控的目标基因


 

l   下游验证:


 

以上就是关于m6A RNA甲基化研究的前期探索性实验及研究思路分享,易基因科技提供全面的RNA甲基化研究整体解决方案,技术详情请致电易基因0755-28317900



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